В 1931 году в городе Козлове (ныне Мичуринск) по инициативе И.В. Мичурина был создан первый институт садоводства в СССР – Центральный НИИ северного плодово-ягодного хозяйства, впоследствии переименованный во Всесоюзный (с 1992 г. Всероссийский) НИИ садоводства. С момента создания институт приступил к непосредственному руководству зональными плодово-ягодными станциями, находящимися в зоне его обслуживания. Позднее он становится главным научным центром, координирующим работу 8 республиканских и 4 зональных институтов, 33 опытных станций по садоводству, 19 отделов садоводства в институтах сельского хозяйства, 20 кафедр плодоводства сельскохозяйственных вузов и 44 сельскохозяйственных опытных станций.
В разные периоды институтом руководили:
• Рейборт Леонид Иосифович (1931-1933 гг.);
• Одинцов Василий Алексеевич (1933-1937 гг.), д.с.-х.н.;
• Белохонов Илья Владимирович (1937-1941 гг., 1947-1952 гг.), д.с.-х.н.;
• Карпов Григорий Карпович (1941-1947 гг.), д.с.-х.н., профессор;
• Абрамов Николай Арсеньевич (1962-1965 гг.), канд.с.-х.н.;
• Степанов Сергей Николаевич (1965-1977 гг.), д.с.-х.н., профессор, заслуженный деятель науки РСФСР;
• Грязев Виталий Афанасьевич (1977-1984 гг.), д.с.-х.н.;
• Болдырев Михаил Иванович (1984-1988 гг.), д.с.-х. н., профессор, заслуженный деятель науки РФ;
• Гудковский Владимир Александрович (1988-2007 гг.) д.с.-х.н. профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ;
• Трунов Юрий Викторович (2007 – 2016 гг.) д.с.-х.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ.
Выполняя функции методического центра садоводства, институт разрабатывал программы научных исследований, методики и рекомендации для научных учреждений и производства, решал весь комплекс вопросов, связанных с организацией и реконструкцией плодово-ягодного хозяйства СССР. Одной из основных задач института на первом этапе являлось развертывание селекционной работы и сортоиспытания сортов, т.е. он осуществлял сортовую политику – снабжал опытные и хозяйственные организации посадочным материалом плодовых и ягодных культур, консультировал все заинтересованные ведомственные организации, готовил высококвалифицированные кадры (всего через аспирантуру подготовлено более 350 специалистов для науки и производства).
50-е годы – начало второго этапа бурного развития отечественнного садоводства, основанного на опыте работы первых передовых хозяйств и достижениях науки в различных областях – селекции, агротехники, механизации, хранении. Сотрудниками института были разработаны мероприятия, обеспечивающие снижение периодичности плодоношения яблони и груши и повышение урожайности садов. Подразделялись они на основные, применяемые регулярно в саду, и специальные, проводимые по фазам вегетации в зависимости от предполагаемого урожая.
В 60-е годы учеными института предложены важнейшие для эффективного ведения садоводства мероприятия, обеспечивающие получение ранних и высоких урожаев – уплотненные схемы размещения плодовых растений, позволившие сократить срок вступления насаждений в плодоношение и повысить их продуктивность.
На следующем этапе деятельности институт укрепляет позиции ведущего комплексного НИИ садоводства. В 1982 г. в институте создается лаборатория биотехнологии растений. Проводится большой объем исследований по физиологии плодовых и ягодных культур. В 1987 г. создан Инженерный центр «Садпитомникмаш», задачей которого был выпуск и поставка разработанных машин по заказам садоводческих хозяйств.
4 ноября 2003 года Президент Российской Федерации подписал Указ о присвоении городу Мичуринску статуса наукограда. Этим Указом определяется социальная значимость научных исследований научных учреждений города, в том числе ВНИИС им. И.В. Мичурина – разработка научных основ для обеспечения населения в течение круглого года свежими плодами и ягодами, высококачественными продуктами переработки функционального назначения, что особенно актуально при решении проблемы повышения качества жизни человека, его физического здоровья и здоровья нации в целом.
В результате многолетней деятельности во ВНИИС им. И.В. Мичурина создано более 150 сортов плодовых, ягодных и свыше 200 сортов цветочно-декоративных культур; более 60 сортов садовых культур и 7 форм клоновых подвоев яблони и груши включено в Государственный реестр селекционных достижений.
Ведущие ученые института:
М.В. Белохонов, А.Н. Веньяминов, Н.И. Герасимов, В.А. Гудковский, П.Ф. Дуброва, В.К. Заец, З.И. Иванова, С.И. Исаев, М.Ф. Киреева, А.К. Кондаков, Е.П. Куминов, В.К. Кутейников, Г.А. Лобанов, Т.В. Морозова, А.А. Новиков, А.С. Овсянников, Н.П. Семина, К.Д. Сергеева, С.Н. Степанов, П.К. Урсуленко, А.В. Четвертаков и многие другие.
Последователи и преемники великих мичуринских ученых подготовили более сотни проектов, книг, методик, рекомендаций для НИИ и производства по всем направлениям сельскохозяйственной науки – селекции, биотехнологии, агротехники, механизации, хранению, экономике, декоративному садоводству. Сотрудники института за вклад в развитие садоводства имеют многочисленные награды – почетные грамоты, медали, дипломы.
24 ноября 2016 года ВНИИС имени И.В. Мичурина в результате реорганизации вошел в состав Федерального научного центра имени И.В. Мичурина на правах базового учреждения.

Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и селекции плодовых растений имени И.В. Мичурина» был основан в 1918 году на экспериментальной базе многолетней деятельности И.В.Мичурина, вначале как Опытно-помологический питомник, который в 1923 году Постановлением СНК РСФСР признан научно-исследовательским учреждением, имеющим общегосударственное значение.
Становлению института как крупного научного центра в значительной мере способствовал Н.И. Вавилов, который уделял ему большое внимание и 4 раза посещал в научных целях. В 1928 году Питомник преобразован в Селекционно-генетическую станцию плодовых культур, а с 1934 года переименован в Центральную генетическую лабораторию им. И.В. Мичурина, которая на правах научно-исследовательского института вошла в состав ВАСХНИЛ. За заслуги в развитии биологической науки, выведение новых сортов плодовых и ягодных культур и подготовку научных кадров в 1967 году учреждение награждено орденом Трудового Красного Знамени.
В 1992 году учреждение получило статус Всероссийского научно-исследовательского института генетики и селекции плодовых растений им. И.В. Мичурина Российской академии сельскохозяйственных наук.
В институте работали выдающиеся ученые, исследования которых получили мировую известность, и внесли крупный вклад в развитие садоводческой науки: лауреаты Государственной премии П.Н. Яковлев (академик ВАСХНИЛ), профессора С.Ф. Черненко, А.И. Потапенко, А.Я. Кузьмин; члены-корреспонденты ВАСХНИЛ И.С. Горшков, Я.С. Нестеров; известные селекционеры профессора П.А. Жаворонков, Х.К. Еникеев, Г.А. Курсаков, С.П. Яковлев; крупный цитогенетик профессор Д.Ф. Петров, академик РАН, доктор сельскохозяйственных наук, профессор Н.И. Савельев.
При институте был организован и функционирует селекционный центр по плодово-ягодным культурам, зона деятельности которого охватывает Центральные и Поволжские регионы РФ.Развиваются комплексные научные исследования с научно-исследовательскими учреждениями России и стран СНГ, а также Германии, Мексики.
Всего подготовлено более 200 молодых специалистов, многие из которых стали ведущими учеными в области плодоводства.
24 ноября 2016 года вошел в состав Федерального научного центра имени И.В. Мичурина как структурное подразделение «Селекционно-генетический центр».

В начале ХХ века на опытном поле в окрестностях Тамбовской губернии были заложены основы научной селекции, начата разработка систем земледелия, способных противостоять жестким засухам; предложены организационные основы семеноводства как ключевого звена сельскохозяйственного производства.

В 1910 году Губернским Собранием был принят и одобрен проект орга¬низации опытных учреждений в Тамбовской губернии, намечающий устройст¬во нескольких опытных полей и одной внутрирайонной опытной станции.
Основателем и первым руководителем Тамбовской сельскохозяйственной опытной станции М.П. Архангельский (с 1912-1916 гг.). Им написано 12 научных монографий по вопросам сортоиспытания картофеля, овса, яровых пшениц, об испытании действия минеральных туков внесенных под овес и о возделывании подсолнечника в Тамбовской губернии.
Программа научных исследований первого периода (1912-1931 гг.) вклю¬чала вопросы обработки почвы, использования органических и минеральных удобрений в парах и под различные сельскохозяйственные культуры, сроки и способы посева озимой ржи, овса, проса и картофеля.
Значительную работу провел ботанический питомник под руководством профессора Л.А. Пельциха. Были выявлены лучшие сорта овса, проса и картофеля, которые получили ши¬рокое распространение в крестьянских хозяйствах, а затем в колхозах и совхо¬зах области. С первых лет своей деятельности опытная станция приобрела ши¬рокую популярность среди передового крестьянства, агрономов и мелких землевладельцев губернии.
С 1930-1943 годы неоднократно менялись названия и статус научного учреждения. Так, в 1931 году Тамбовская сельскохозяйственная опытная станция была ре¬организована в Чакинскую селекционную опытную станцию. Главным приоритетом для коллектива и руководителей было активное участие в решении научных и практических задач развития сельскохозяйственного производства Тамбовской губернии.
Руководителями станции были: А.К. Леонов (1930-1933 гг.), В.А. Быстров (1933-1935 гг.), И.Г. Прамштейн (1935-1938 гг.), В.К. Рогачев (1938-1943 гг.). В этот период был разработан комплекс агротехнических приемов для возделывания озимых хлебов, яровой пшеницы, овса, проса. Основным направлением опытной станции было – выведение новых высокоурожайных сортов и снабжение хозяйств элитными семенами. Были выявлены основные приемы травопольной системы земледелия.
За период с 1931 по 1956 годы коллектив станции вывел ряд сортов, ко¬торые были районированы в Тамбовской области и за ее пределами. Среди них наибольшее распространение в производстве получили: овес Чакинский 1812 (авторы: Э.В. Эйхенбаум, П.И. Богданов, А.К. Корягин и Н.Д. Фирсанова), просо Тойденское 215 (автор З.С. Чернявская), Воронежское 3985 и Родина (авторы: З.С. Чернявская и Л.А. Фильберт), яровая пшеница Чакинская 226 (авторы: П.И. Богданов, Е.Н Фолькман, Т.Е. Чухрай) и кукуруза Чакинская жемчужина авторы: Л.А. Пельцих, Н.И. Вайт).
За период с 1948 по 1955 гг. опытную станцию возглавляли А.И. Козлов (1945-1948 гг.), С.М. Калинин (1945 г.), И.Л. Козлов (1946-1953 гг.), Г.П. Глубоков (1953-1955 гг.). В эти годы были разработаны приемы использования травопольного пласта, выведены новые сорта твердой яровой пшеницы, изучена агротехника кукурузы на зерно и силос.
Назначенный в 1955 году директором опытной станции Б.А. Быстров начал активную работу по расширению научно-производственной базы станции за счет передачи совхозов «Маяк» и «Ярославка». Были открыты новые научные отделы: экономики, животноводства, защиты растений и механизации. Учитывая возросшую роль опытной станции для сельскохозяйственного производства всей Тамбовской области, она была реорганизована в Тамбовскую государственную областную сельскохозяйственную опытную станцию. Таким образом, опытная станция превратилась в комплексное научно-исследовательское учреждение, способное обслуживать многоотраслевое сельскохозяйственное производство. Коллективом станции под руководством Б.А. Быстрова была проделана большая работа по разработке научно обоснованной системы ведения хозяйства для колхоза «Красный Путиловец» Ржаксинского района.
В 1956 году Чакинская государственная селекционная станция, в связи с изменением направления работы, реорганизована в Тамбовскую государственную областную сельскохозяйственную опытную станцию.
В 1961-1973 гг. станцию возглавлял А.И. Туровский. Активно укреплялась материальная база науки и опытных хозяйств, обновлялась техника. Было развернуто жилищное строительство для сотрудников, начато строительство трехэтажного административно-лабораторного корпуса, закуплено оборудование для химической лаборатории.
В связи с возросшей потребностью колхозов и совхозов в высококачественных семенах всех районированных сортов, в 1961 году К.Р. Кулешовым был организован отдел семеноводства зерновых культур, который он возглавил.
В 1982 г. совместно с областным управлением сельского хозяйства под руководством Н.Д. Коновалова научным коллективом опытной станции были разработаны и изданы книги: «Система земледелия Тамбовской области», в 1985 г. – «Система ведения сельского хозяйства Тамбовской области». В 1998 году он был редактором книги «Система ведения агропромышленного производства Тамбовской области до 2005 года». В 2002 году издал книгу «Динамика изменения погоды за 1891-2000 гг. на территории Тамбовской области и урожайности полевых культур».
30 апреля 1991 года Государственная сельскохозяйственная опытная станция была реорганизована в Тамбовский научно-исследовательский институт сельского хозяйства.
Назначенный директором Тамбовского НИИСХ кандидат сельскохозяйственных наук С.П. Медведев (2002-2007 гг.) вместе с учеными и специалистами начали интенсивную работу по укреплению коллектива, расширению и разработке новых научных направлений, формированию научно-организационной структуры института.
В состав Тамбовского НИИСХ в 2003 году вошел филиал «Среднерусская научно-исследовательская фитопатологическая станция» с научными лабораториями. В 2007 году Тамбовский НИИСХ возглавила Л.Н. Вислобокова. Основные направления научно-исследовательской работы: земледелие, фитопатология, селекция зерновых и масличных культур. Сотрудники института проводят совместно с другими научно-исследовательскими институтами работу по селекции ячменя, пшеницы и подсолнечника. Сорта, созданные в институте, включены в Госреестр и выращиваются в Тамбовской области и других регионах: ячмень – Чакинский 221, подсолнечник – Чакинский 602, Чакинский 931, Спартак, Чакинский 77.
На момент вхождения в состав Федерального научного центра 24 ноября 2016 года в качестве Тамбовского филиала ФНЦ в штате института работают 128 специалистов, из них 1 доктор сельскохозяйственных наук, 14 – кандидатов сельскохозяйственных наук и 5 аспирантов.